jueves, 28 de enero de 2016

BOOKLETS DNA

Here you have the booklet in English:  DNA


Aquí teneis el resumen en español: ADN


EXAM NEXT WEEK, 3RD AND 4TH FEBRUARY!!!!


EXAMEN LA SIGUIENTE SEMANA, DÍAS 3 Y 4 DE FEBRERO!!!!

FROM DNA TO PROTEINS: TRANSLATION (DE ADN A PROTEíNAS: TRADUCCIÓN)

During the Transcription a gen (DNA segment with information for a protein) has been copied thanks to a RNA-polymerase into a RNA-m (messenger). This RNA-m can leave the nucleus through its membrane pores with the information to produce the protein. So, it arrives to the cytoplasm, where the ribosomes will develop the next step, the TRANSLATION.

Durante la Transcripción un gen (segmento de ADN con información para una proteína) ha sido copiado, gracias a una ARN-polimerasa, a un ARN-m (mensajero). Este ARN-m puede dejar el núcleo a través de los poros de su membrana, con la información para producir la proteína. Así, llega al citoplasma, donde los ribosomas realizarán el siguiente paso, la TRADUCCIÓN.




* GENETIC CODE (CÓDIGO GENÉTICO).

We are going to translate a language of 4 letters, the bases (A, U, G and C), into a language of 20 components, the amino acids. How is that possible? This is due to the fact that each 3 letters in the RNA-m sequence, which is called a CODON, determine an amino acid. That´s what we can see in one of the two model codon charts:

Vamos a pasar de un lenguaje de 4 letras, las bases (A, U, G y C) a un lenguaje de 20 componentes, los aminoácidos. ¿Cómo es eso posible? Es debido al hecho que cada 3 letras en la secuencia del ARN-m, lo que se llama un CODÓN, determina un aminoácido. Esto lo podemos observar en cualquiera de los dos modelos de tablas de codones:




* STEPS IN TRANSLATION (PASOS EN LA TRADUCCIÓN)

1. The RNA-m joins to the ribosome.


2. The translation begins when the ribosome detects the starting codon AUG.

3. The first t-RNA (transfer RNA) arrives with the ANTICODON complementary to the starting codon, so it would be UAC, and carrying the first amino acid: Met (methionine), 



4. The ribosome reads the next codon, and the second t-RNA, with the complementary anticodon and the right amino acid, will arrive. Then the third one, and so on.


5. The process finishes when the ribosome reads one of the three possible STOP CODONS: UAA, UAG or UGA. In that moment, the ribosome releases the protein and the RNAm. 



1. El ARN-m se une al ribosoma.
2. La traducción comienza cuando el ribosoma detecta el CODÓN DE INICIO: AUG.
3. El primer t-ARN (ARN de transferencia) llega con el ANTICODÓN complementario al codón de inicio, aí que sería UAC, y llevando el primer aminoácido: Met (metionina).
4. El ribosoma lee el siguiente codón, y el segundo ARN-t con el anticodón complementario y el aminoácido correcto llega. A continuación el tercer codón, etc.
5. El proceso acaba cuando el ribosoma lee uno de los tres posibles CODONES DE PARADA: UAA; UAG o UGA. En ese momento, el ribosoma libera la proteína y el ARN-m.





To practice:     translation
                    Protein synthesis






lunes, 25 de enero de 2016

FROM DNA TO PROTEINS: TRANSCRIPTION. (DE ADN A PROTEÍNAS: TRANSCRIPCIÓN)

Each one of our cells has a copy of our DNA. In it we have our information, but not only about our traits, but the information to produce proteins that our body needs in order to survive. So in our DNA we have many different genes. A GENE is a short piece of DNA with the information to produce certain protein.

Cada una de nuestras céluas tiene una copia de nuestro ADN. En ella tenemos nuestra información, y no solo sobre nuestros rasgos, sino también la informacion para producir proteínas que nuestro cuerpo necesita para sobrevivir. Así que en nuestro DNA tenemos muchos genes diferentes. Un GEN es un segmento de DNA con la información para producir cierta proteína.




When we need to produce a certain protein, we have a problem: the information for it is in our DNA inside the nucleus of the cell, and the organelles that produce the proteins are the ribosomes that are located in the cytoplasm. The DNA never leaves the nucleus, so how does the information go from the nucleus to the ribosomes in the cytoplasm? The answer is that we have two different processes that go together: TRANSCRIPTION AND TRANSLATION

Cuando necesitamos producir cierta proteína, nos encontramos con un problema: la información para ésta se encuentra en nuestro ADN dentro del núcleo de la célula, y los orgánulos que producen las proteínas son los ribosomas localizados en el citoplasma. El ADN nunca deja el núcleo, así que ¿cómo llega la información hasta los ribosomas en el citoplasma? La respuesta es que tenemos dos procesos que van juntos: TRANSCRIPCIÓN Y TRADUCCIÓN.


* TRANSCRIPTION (TRANSCRIPCIÓN)

The gen with the information for the protein is located in the DNA inside the nucleus, that cannot leave it. So the solution is to produce a new molecule, called RNA-MESSENGER or RNAm, that can do it. For that, there is a new enzyme, the RNA-POLYMERASE, which goes reading the nucleotides in the gene and creates a complementary strand, but instead of being of DNA is of RNA. How can we know that? Easy, in the DNA we have 4 bases: A, G, C and T. In the RNA there are also 4 bases: A, G, C and U (uracil) instead of T (thymine doesn´t exist in RNA). When the strand is transcribed, it leaves the nucleus through the nuclear pores.

El gen con la información para la proteína está localizada en el ADN dentro del núcleo, que no puede dejarlo. Así que la solución es producir una nueva molécula llamada ARN-MESNAJERO o ARNm, que puede hacerlo. Para ello, hay una nueva enzima, la ARN-POLIMERASA, que va leyendo los nucleótidos en el gen y crea una hebra complementaria, pero en vez de ser de ADN es de ARN. ¿Cómo podemos saber eso? Fácil, en el DNA tenemos 4 bases: A, G, C y T. En el ARN también hay 4 bases: A, G, C y U (uracilo) en vez de T (la timina no existe en el RNA). Cuando la hebra es transcrita, deja el núcleo a través de los poros del núcleo.







* DIFFERENCES BETWEEN DNA AND RNA (DIFERENCIAS ENTRE ADN Y ARN)




Review exercise: DNA vs RNA






domingo, 24 de enero de 2016

DNA REPLICATION (REPLICACIÓN DEL ADN)


When cells reproduce (because we are growing, or we have to repair tissues), before the mitosis the DNA has to be duplicated. This happens during the S phase of the cell cycle, and the duplication or replication of the DNA is called SEMICONSERVATIVE: it means that from one double helix we obtain two double-helix, each one with a new strand and one of the old strands.

Cuando las células se reproducen (porque estamos creciendo, o tenemos que reparar tejidos), antes de que ocurra la mitosis el ADN tiene que ser duplicado. Esto ocurre durante la fase S del ciclo celular, y la duplicación o replicación del ADN se llama SEMICONSERVATIVA: significa que desde un doble hélice vamos a obtener dos dobles hélices, cada una formada por una hebra nueva y una de las hebras viejas.



The steps for replication are:
1. The DNA molecule is unzipped by the enzyme helicase.
2. The point where the DNA opens is called replication fork.
3. Another enzyme, the DNA-polymerase, goes reading the bases sequence in a strand, creating a complementary strand.
4. Both strands get a new complementary one, one directly, the other goes in opposite direction, so the DNA polymerase goes creating little fragments (Okazaki fragments). Then a ligase enzyme will bond them.
In eukaryotes there are several points opening at the same time, so the replication takes place faster.


Los pasos para la replicación son:
1. La molécula de ADN es abierta por la enzima helicasa.
2. El punto donde el ADN se abre se llama horquilla de replicación.
3. Otra enzima, la ADN-polimerasa, va leyendo la secuencia de bases es una hebra, creando una hebra complementaria.
4. Ambas hebras consiguen una hebra complementaria, una directamente, la otra va en dirección contraria, así que la ADN polimerasa va creando pequeños frgmentos (fragmentos de Okzaki). Luego un enzima ligasa los unirá.
En eucariotas hay varios puntos abiréndose a la vez, para que la replicación vaya más rápida.



Reviewing exercise: REPLICATION


martes, 19 de enero de 2016

UNIT 7- DNA (ADN)

The DNA is the molecule that has all our information, and that´s its main function: to carry information. It has a double-helix shape, formed by basic units called NUCLEOTIDES, and they are formed by three subunits: a phosphate group, a pentose sugar (deoxyribose) and a nitrogenous base.


El ADN es la molécula que tiene toda nuestra información, y esa es su función principal: llevar la información. Tiene forma de doble hélice, formada por unas unidades básica llamadas NUCLEÓTIDOS, que están formados por tres subunidades: un grupo fosfato, un azucar pentosa (desoxirribosa) y una base nitrogenada.


The phosphate group and the pentose are always the same in the DNA, but not the nitrogenous base part, because there are four different nitrogenous bases: ADENINE, GUANINE, CYTOSINE and THYMINE

El grupo fosfato y la pentosa son siempre los mismos en el DNA, pero no las bases nitrogenadas, porque hay cuatro bases distintas: ADENINA; GUANINA; CITOSINA Y TIMINA.


The sequence of the bases is the part of the DNA that determines the information and that is different in the organisms. One of the strands of the DNA has a certain sequence of bases, the other strand carries the complementary sequence (so it is called the COMPLEMENTARY STRAND) and they get joined by HYDROGEN BONDS between the bases: two between A (adenine) and T (thymine) and three between C (cytosine) and G (guanine).

La secuencia de las bases es la parte del ADN que determina la información y que es diferente en los organismos. Una de las hebras del ADN tiene una cierta secuencia de bases, la otra hebra lleva la secuencia complementaria (así que se llama HEBRA COMPLEMENTARIA) y se mantienen unidas por ENLACES DE HIDRÓGENO entre las bases: dos entre A (adenina) y T (timina) y tres entre C (citosina) y G (guanina).




This structure was discovered by Watson and Crick in 1953, with the help of the work of Rosalind Franklin, who took a photograph of the DNA with X-ray diffraction, the famous photograph 51. They also had the work of another scientist, Chargaff, who discovered, before the structure of the DNA was known but knowing the components, that the amount of A was equal to the amount of T, and the amount of G was as the amount of C.

Esta estructura fue descubierta por Watson y Crick en 1953, con la ayuda del trabajo de Rosalind Franklin, que tomó una fotografía del DNA con difracción de rayos X, la famosa fotografía 51. También tenían el trabajo de otro científico, Chargaff, quien desubrió, antes de que la estructura del DNA fuera conocida pero conociendo los componentes, que la cantidad de A era igual que la cantidad de T, y la cantidad de G era como la cantidad de C.



Activity to review structure: DNA structure


* FOLDABLE: NUCLEOTIDES






* DNA STRUCTURE WITH CANDIES



lunes, 11 de enero de 2016

Reviewing Classical Genetics

Here you have a ppt presentation with the revision of all the content for the Genetics Exam.

PPT Genetics Review

sábado, 2 de enero de 2016

INCOMPLETE DOMINANCE, CODOMINANCE, SEX LINKED TRAITS (DOMINANCIA INCOMPLETA, CODOMINANCIA, GENES LIGADOS AL SEXO)

But surprisingly not all the crosses follow Mendel´s Laws. There are some types of crosses that don't follow the basic rules he discovered. We are going to see the most typical cases:

Para gran sorpesa no todos los cruces siguen las Leyes de Mendel. Hay algunos tipos de cruces que no siguen las reglas básicas que él descubrió. Vamos a ver los tipos más típicos:


* INCOMPLETE DOMINANCE (DOMINANCIA INCOMPLETA)

In this case when we make the cross between two homozygous organisms for a trait, like the flower color in the "snapdragon" plant that can be red (CrCr) or white (CwCw), the offspring will have an intermediate color between the two of the parents, it is, like a mixture, in this case, pink (CrCw).

En este caso cuando hacemos un cruce entre dos organismos homocigotos para un rasgo, como el color de las flores para la planta "boca de dragón" que pueden ser rojas (CrCr) o blancas (CwCw), la descendencia tendrá un color intermedio entre el de los padres, esto es, como una mezcla, en este caso, rosa (CrCw).




* CODOMINANCE (CODOMINANCIA)

This is what happens to human blood types. There are three different alleles in our blood, Ia, Ib and i. The allele Ia codifies for the presence of a protein, called the protein A, in the surface of our red blood cells. The Ib codifies for another one, the protein B. And finally, the third allele, i, codifies for the absence of both proteins.

Esto es lo que ocurre con los grupos sanguíneos humanos. Hay tres diferentes alelos en nuestra sangre, Ia, Ib e i. El alelo Ia codifica para la presencia de una proteína, llamada la proteína A, en la superficie de nuestros glóbulos rojos. El Ib codifica para otra proteina, la proteína B. Y finalmente, el tercer alelo, i, codifica para la ausencia de ambas proteínas.


Both alelles Ia and Ib are dominant to i, which is the recessive allele. But between them, Ia and Ib are CODOMINANTS, it means, if a person has the combination IaIb, this person will have both proteins A and B on the surface of the red blood cells. So finally, all the possible combinations are:

Ambos alelos, Ia e Ib son dominantes frente al i, que es el alelo recesivo. Pero entre ellos, Ia e Ib son CODOMINANTES, que significa que si una persona tiene la combinción IaIb, esta persona tendrá ambas proteínas, A y B, en la superficie de sus glóbulos rojos. Así que finalmente, las posibles combinaciones son:



* SEX LINKED TRAITS (GENES LIGADOS AL SEXO)

The sex in humans is determined by two chromosomes, X and Y. If you are a female, you have two X chromosomes, so you are XX. If you are a male, you have a X chromosome and a Y chromosome, so you are XY. But there are differences between the X and the Y chromosomes:

El sexo en los humanos es determinado por dos cromosomas, X e Y. Si eres una hembra, tienes dos cromosomas X, eres XX. Si eres un macho, tienes un cromosoma X y un cromosoma Y, así que eres XY. Pero hay diferencias entre los cromosomas X e Y:



The Y chromosome, that is smaller, lacks some genes respect to X chromosome. How does this affect human? Some traits, like being bald, depends on the sex of the person. It's less frequent to see bald women due to the fact that is a recessive trait located in the X chromosome, so it has to be in both X chromosomes to be expressed. But in men is different, the chromosome Y doesn't have this gene, so only being present one in the X chromosome they have, it is expressed.

El cromosoma Y, que es más pequeño, carece de algunos genes con respecto al cromosoma X. ¿Cómo afecta esto a los humanos? Algunos rasgos, como el ser calvo, depende del sexo de la persona. Es menos frecuente el ver mujeres calvas debido a que es un rasgo recesivo localizado en el cromosoma X, así que tiene que estar en los dos cromosomas X para expresarse. Pero en hombres es diferente, el cromosoma Y no tiene este gen, así que estando presente solo en el cromosoma X que tienen, se expresa.



Some exercises to practice: Codominance exercise   Sex linked   Blood disorders